2043年7月1日，犯罪大王將軍(盧惠光飾)被捕，一星期后由鐵面無私的法官余鐵雄(張衛健飾)主審。將軍特派其黑社會爪牙健(鄭伊健飾)返回50年前尋找鐵雄，并將其洗腦使他無法進行審判。政府知情后特派飛龍特警鐵面(劉德華飾)、掃帚頭(張學友飾)及發達星(任達華飾)返回1993年去保護鐵雄。 時大雄為93年一中學長期留班生，常遭同學余忌安(許志安飾)作弄毒打，只有女友采妮(楊采妮飾)對他真心。飛龍三特警混進學校，掃帚頭當上老師，鐵面做大雄同學，星則任大雄跟班，幫大雄打贏忌安，并向他套取鐵雄下落，但大雄卻表示校內并無鐵雄此人。在這時健亦扮成老師混入學校，另一邊大雄母親要改嫁理查德余……最終飛龍特警能完成任務嗎？